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aminoXpress_aminoXpress下載|aminoXpressV7.7.0.0版

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  aminoXpress集成了生物化學家每天執行的常見功能。除了傳統的序列輸入協議之外,該程序還提供了一種新的通過構建模塊和相應計數輸入序列的協議。這為程序處理非常復雜、分支、循環和冗長的序列提供了可能性。該程序還通過其用戶可定義的片段數據庫將其適用范圍擴展到普通有機化學。
 
  功能介紹
 
  1.氨基酸分析:該模塊計算氨基酸分析結果的最佳殘基比。通過將水解過程中容易氧化的殘留物輸入“未優化殘留物”部分,可以將對優化結果的影響降至最低。
 
  2.復合構建模塊組成:該模塊基于構建模塊(氨基酸、片段)擁有離散的重量值這一事實來識別意外產品的身份。掃描它們的組合后,偏差最小的更有可能是衍生產品。
 
  3.消化模式:該模塊通過用戶定義的酶或化學模式預測消化產物。
 
  元素分析:該模塊計算序列中不同元素的理論百分比。通過進一步輸入每個元素的實驗百分比組成,可以識別其經驗公式和/或其聚集體。
 
  4.碎片化:該模塊預測質譜中通過三種類型的鍵斷裂產生的碎片:一氧化碳/一氧化碳、一氧化碳/碳氫化合物和碳氫化合物/碳氫化合物。生成的碎片可以直接導入到質量模塊中,用于模擬質量分布模式。
 
  5.螺旋輪/網:這個模塊顯示和操作螺旋結構的順序輪/網顯示。
 
  6.同位素分布圖:這個模塊預測輸入公式或序列的同位素分布圖,以1到3的電荷變化的或模式
 
  7.Lib組合庫:本模塊預測組合庫(如肽庫)的質譜,以1-3電荷的或模式進行。直到最后一步才進行質量舍入,以確保準確性。此外,該模塊將其預測能力擴展到有機文庫:隨機變體可以是氨基酸、片段或兩者兼有。結果還包括隨機的截面殘余組合
 
  8.主題發現:該模塊通過模式識別預測序列中潛在的藥物活性位點。它有助于掃描預設模式或隨機重復模式、潛在的藥效團,以及展示相同生物活性的加載序列。
 
  9.分子量:這個模塊計算肽和蛋白質的分子量。輸入可以通過常規的序列方案進行,也可以通過構建模塊如氨基酸和片段進行。替代方案使模塊能夠計算復雜分子的分子量,例如具有保護基團的肽、肽模擬物、長分子和分支分子等。原子量的進一步使用通常擴展了模塊計算任何化合物分子量的能力。
 
  輔助描述
 
  10.數據庫數據庫管理:這個輔助模塊允許用戶管理在這個程序中使用的所有數據庫,如氨基酸數據庫,片段附加數據庫...等等。開放式設計允許用戶根據他們的特定項目定制數據庫。
 
  11.序列序列加載器:這個輔助模塊允許用戶將序列加載并解析到相應模塊的入口部分。專家系統自動識別諸如側鏈、環狀結構、假替換和附加加合物的屬性。
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